Gen de la subunidad proteica mitocondrial CO3 y RNA 15

 

La proteína CO3 del genoma mitocondrial humano, también es llamada subunidad 3 del COMPLEJO IV de la cadena transportadora de electrones, y subunidad 3 de la Citocromo oxidasa.

protein_id = AAB58949.1

Estructura primaria de 260 aminoácidos :

 

MTHQSHAYHMVKPSPWPLTGALSALLMTSGLAMWFHFHSMTLLMLGLLTNTLTMYQWWRDVTRESTYQGH

HTPPVQKGLRYGMILFITSEVFFFAGFFWAFYHSSLAPTPQLGGHWPPTGITPLNPLEVPLLNTSVLLAS

GVSITWAHHSLMENNRNQMIQALLITILLGLYFTLLQASEYFESPFTISDGIYGSTFFVATGFHGLHVII

GSTFLTICFIRQLMFHFTSKHHFGFEAAAWYWHFVDVVWLFLYVSIYWWG                              

 

RNA 15 : Este mRNA está poliadenilado. Se encuentra entre las posiciones 9207 y 9987 del DNA mitocondrial, estando a continuación la cola polyA ( en negrita ).

En la base de datos del Genbank tiene un error al señalarlo desde 9207 a 9990, lo que originaría en la ORF un aminoácido adicional ( Serina ) C-terminal que no existe en la proteína.

Longitud del RNA 15 : 781 nucleotidos + cola polyA

La ORF de 783 nucleotidos está comprendida entre las posiciones del genoma 9207 y 9987 + las dos primeras As de la cola polyA que forman parte del codon STOP UAA ( en la secuencia Fasta format TAA). Iniciandose con AUG (ATG). 

Su secuencia Fasta format es:

 

 .... .......... .......... cacataatga cccaccaatc acatgcctat catatagtaa

 9241 aacccagccc atgaccccta acaggggccc tctcagccct cctaatgacc tccggcctag

 9301 ccatgtgatt tcacttccac tccataacgc tcctcatact aggcctacta accaacacac

 9361 taaccatata ccaatgatgg cgcgatgtaa cacgagaaag cacataccaa ggccaccaca

 9421 caccacctgt ccaaaaaggc cttcgatacg ggataatcct atttattacc tcagaagttt

 9481 ttttcttcgc aggatttttc tgagcctttt accactccag cctagcccct accccccaat

 9541 taggagggca ctggccccca acaggcatca ccccgctaaa tcccctagaa gtcccactcc

 9601 taaacacatc cgtattactc gcatcaggag tatcaatcac ctgagctcac catagtctaa

 9661 tagaaaacaa ccgaaaccaa ataattcaag cactgcttat tacaatttta ctgggtctct

 9721 attttaccct cctacaagcc tcagagtact tcgagtctcc cttcaccatt tccgacggca

 9781 tctacggctc aacatttttt gtagccacag gcttccacgg acttcacgtc attattggct

 9841 caactttcct cactatctgc ttcatccgcc aactaatatt tcactttaca tccaaacatc

 9901 actttggctt cgaagccgcc gcctgatact ggcattttgt agatgtggtt tgactatttc

 9961 tgtatgtctc catctattga tgagggtAAA AAAAAAAAAA AAAA....... ..........

 

cadena H

pseudogenes mitocondriales

genes de tRNAs

genes de mRNAs

cadena transportadora

cadena L

nomenclatura aminoácidos

código estandar

código mitocondrial

genes de rRNAs

secuencias de DNA

expresión del mitDNA

mitobase proteica

el mitomapa

oligocalculator

herramientas de cálculo

terapia génica y ética

links

la mitocondria humana

página principal