Mutaciones en MTCO1 y enfermedades mitocondriales causadas por mutación en MTCO1
El gen MTCO1 es el blanco de mutaciones puntuales en las posiciones :
ORF ...... gac cgt tga cta ttc ........
PROTEÍNA ...... D R W L F ........
mutación en DNA: G5920A cambio en proteína : W-STOP
ORF ...... gac cgt tAa cta ttc ........
PROTEÍNA ...... D R STOP ........
SE PRODUCE UN CAMBIO EN EL AMINOÁCIDO EN POSICIÓN 6 A UNA SEÑAL DE STOP.
Esto genera un péptido MTCO1 de solo 5 aminoácidos frente a los 513 de la MTCO1 normal.
ORF ...... gcc cta gga ttc atc ........
PROTEÍNA ...... A L G F I ........
mutación en DNA: G6930A cambio en proteína : G-STOP
ORF ...... gcc cta Aga ttc atc ........
PROTEÍNA ...... A L STOP ........
SE PRODUCE UN CAMBIO EN EL AMINOÁCIDO EN POSICIÓN 343 A UNA SEÑAL DE STOP.
Esto genera un péptido MTCO1 de solo 342 aminoácidos frente a los 513 de la MTCO1 normal.
mRNA ... aaa tct aga caa aaa agg aag gaa .......
ORF ... aaa tct aga
PROTEÍNA ... K S STOP
mutación en DNA: G7444A cambio en proteína : STOP-K
mRNA ... aaa tct aAa caa aaa agg aag gaa .......
ORFNUEVA ... aaa tct aAa caa aaa agg
PROTEÍNA ... K S k Q K STOP
SE PRODUCE UN CAMBIO EN EL TRIPLETE 514 ( aga ) QUE ES LA SEÑAL DE STOP DE LA ORF NORMAL FORMADA POR 514 TRIPLETES, DE LOS CUALES 513 CODIFICAN PARA LA PROTEÍNA DE 513 AMINOÁCIDOS MTCO1 Y EL 514 ES LA SEÑAL STOP.
La mutación G7444A genera la desaparición de la señal STOP con lo que la nueva ORF se verá alargada hasta el siguiente triplete STOP - agg - del mRNA. Esto hace que la nueva proteína se vea alargada en tres aminoácidos - KQK - con lo que la proteína mutante tendrá 516 aminoácidos.
La proteína CO1 del genoma mitocondrial humano, también es llamada subunidad 1 del COMPLEJO IV de la cadena transportadora de electrones, y subunidad 1 de la Citocromo oxidasa.
protein_id = AAB58945.1
Estructura primaria de 513 aminoácidos :
MFADRWLFSTNHKDIGTLYLLFGAWAGVLGTALSLLIRAELGQPGNLLGNDHIYNVIVTAHAFVMIFFMV
MPIMIGGFGNWLVPLMIGAPDMAFPRMNNMSFWLLPPSLLLLLASAMVEAGAGTGWTVYPPLAGNYSHPG
ASVDLTIFSLHLAGVSSILGAINFITTIINMKPPAMTQYQTPLFVWSVLITAVLLLLSLPVLAAGITMLL
TDRNLNTTFFDPAGGGDPILYQHLFWFFGHPEVYILILPGFGMISHIVTYYSGKKEPFGYMGMVWAMMSI
GFLGFIVWAHHMFTVGMDVDTRAYFTSATMIIAIPTGVKVFSWLATLHGSNMKWSAAVLWALGFIFLFTV
GGLTGIVLANSSLDIVLHDTYYVVAHFHYVLSMGAVFAIMGGFIHWFPLFSGYTLDQTYAKIHFTIMFIG
VNLTFFPQHFLGLSGMPRRYSDYPDAYTTWNILSSVGSFISLTAVMLMIFMIWEAFASKRKVLMVEEPSM
NLEWLYGCPPPYHTFEEPVYMKS
RNA 9 : Este mRNA está poliadenilado. Se encuentra entre las posiciones 5901 y 7517 del DNA mitocondrial, estando a continuación la cola polyA ( en negrita ).
RNA 6 : Es un RNA poliadenilado precursor del RNA 9.
Longitud del RNA 9 : 1617 nucleotidos + cola polyA
La ORF de 1542 nucleotidos está comprendida entre las posiciones del genoma 5904 y 7445. Iniciandose con AUG (ATG) y terminando con AGA (STOP codon AGA).
Su secuencia Fasta format es:
5881 .......... .......... ctgatgttcg ccgaccgttg actattctct acaaaccaca
5941 aagacattgg aacactatac ctattattcg gcgcatgagc tggagtccta ggcacagctc
6001 taagcctcct tattcgagcc gagctgggcc agccaggcaa ccttctaggt aacgaccaca
6061 tctacaacgt tatcgtcaca gcccatgcat ttgtaataat cttcttcata gtaataccca
6121 tcataatcgg aggctttggc aactgactag ttcccctaat aatcggtgcc cccgatatgg
6181 cgtttccccg cataaacaac ataagcttct gactcttacc tccctctctc ctactcctgc
6241 tcgcatctgc tatagtggag gccggagcag gaacaggttg aacagtctac cctcccttag
6301 cagggaacta ctcccaccct ggagcctccg tagacctaac catcttctcc ttacacctag
6361 caggtgtctc ctctatctta ggggccatca atttcatcac aacaattatc aatataaaac
6421 cccctgccat aacccaatac caaacgcccc tcttcgtctg atccgtccta atcacagcag
6481 tcctacttct cctatctctc ccagtcctag ctgctggcat cactatacta ctaacagacc
6541 gcaacctcaa caccaccttc ttcgaccccg ccggaggagg agaccccatt ctataccaac
6601 acctattctg atttttcggt caccctgaag tttatattct tatcctacca ggcttcggaa
6661 taatctccca tattgtaact tactactccg gaaaaaaaga accatttgga tacataggta
6721 tggtctgagc tatgatatca attggcttcc tagggtttat cgtgtgagca caccatatat
6781 ttacagtagg aatagacgta gacacacgag catatttcac ctccgctacc ataatcatcg
6841 ctatccccac cggcgtcaaa gtatttagct gactcgccac actccacgga agcaatatga
6901 aatgatctgc tgcagtgctc tgagccctag gattcatctt tcttttcacc gtaggtggcc
6961 tgactggcat tgtattagca aactcatcac tagacatcgt actacacgac acgtactacg
7021 ttgtagccca cttccactat gtcctatcaa taggagctgt atttgccatc ataggaggct
7081 tcattcactg atttccccta ttctcaggct acaccctaga ccaaacctac gccaaaatcc
7141 atttcactat catattcatc ggcgtaaatc taactttctt cccacaacac tttctcggcc
7201 tatccggaat gccccgacgt tactcggact accccgatgc atacaccaca tgaaacatcc
7261 tatcatctgt aggctcattc atttctctaa cagcagtaat attaataatt ttcatgattt
7321 gagaagcctt cgcttcgaag cgaaaagtcc taatagtaga agaaccctcc ataaacctgg
7381 agtgactata tggatgcccc ccaccctacc acacattcga agaacccgta tacataaaat
7441 ctagacaaaa aaggaaggaa tcgaaccccc caaagctggt ttcaagccaa ccccatggcc
7501 tccatgactt tttcaaaAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA....... ..........